Investigadores de 35 países participaron en el estudio internacional “A second update on mapping the human genetic architecture of COVID-19” (Segunda actualización sobre el mapeo de la arquitectura genética humana del COVID-19) publicado recientemente en la Revista Nature (https://www.nature.com/articles/s41586-023-06355-3) , que entre sus hallazgos arrojó nuevos antecedentes de tipo genético y también con respecto a importantes factores de riesgo ambientales, como la edad de inicio al consumo de cigarrillos o el número de cigarros consumidos por día, ambos correlacionados de manera positiva con la susceptibilidad y la severidad con la que se manifiesta la enfermedad.
Esto significa que las personas que fuman desde temprana edad y/o consumen varios cigarros por día serían más propensos tanto a infectarse por el virus como a presentar la enfermedad más grave. Esto demuestra que fumar aumenta el riesgo de COVID-19, resaltando la importancia de tener pulmones sanos al momento de enfermarse.
Conjuntamente, se encontró que una mayor filtración glomerular (indicador del buen funcionamiento de los riñones), se asocia con bajo riesgo de presentar la enfermedad de manera más severa.
En el caso de Chile, el equipo estuvo compuesto principalmente por mujeres y participaron científicas y científicos de la U. de Magallanes, U. de Tarapacá, U. Austral, U. de Talca, U. de Antofagasta y U. de Concepción, U. de Chile, U. de Talca y U. de Atacama, además del Hospital del Salvador, el Hospital de Urgencia Pública y la Fundación Arturo López Pérez. Este equipo de investigación formó la Red de Genómica del COVID-19 (C19-GenoNet), proyecto financiado por la iniciativa Anillo de ANID (ACT210085), lo que permitió realizar el estudio en Chile.
Dentro de este grupo, hay dos universidades de las zonas extremas del país: UTarapacá y UMAG. Fueron dos investigadoras las que lideraron este trabajo en sus respectivas zonas. Se trata de Macarena Fuentes Guajardo, tecnólogo médico, PhD. en Genética de la Evolución Humana, profesor asistente de la Facultad de Ciencias de la Salud de la Universidad de Tarapacá y Directora del Centro de Genética y Genómica Uasara de la misma casa de estudios; y Yolanda Espinosa Parrilla, bióloga y genetista, profesora asociada de la Escuela de Medicina de la Universidad de Magallanes y directora del Grupo de Genómica Evolutiva y Médica en Magallanes (GEMMa) del Centro Asistencial Docente e Investigación (CADI-UMAG).
La investigadora Macarena Fuentes de la Universidad de Tarapacá explicó que “la contribución que hicimos como grupo desde Chile es muy importante ya que generalmente en este tipo de estudios genéticos no es común la presencia de latinoamericanos y además la representatividad que logramos debido al enfoque descentralizado del proyecto, incluyendo voluntarios desde el norte hasta el sur del país, contribuye aún más”.
En este sentido, añadió que “el aporte que se hizo desde el norte del país es muy importante, ya que una de las regiones con mayor número de personas con ancestría aymara del país es esta, entonces no solo estamos contribuyendo con población latinoamericana, sino que además estamos contribuyendo con en componente nativo americano, que es aún más escaso en estos estudios. Por ejemplo el año 2019, en este tipo de estudios la presencia de personas con ancestría diferente a la europea o asiática era de menos del 4%, por supuesto con el paso de los años esto ha mejorado, pero aún no es suficiente pensando el que el futuro de la medicina es la medicina de precisión y para eso es importante tener bien caracterizada a la población desde el punto de vista genético.”
En tanto, Yolanda Espinosa Parrilla, de la U. de Magallanes, sostuvo que “esta investigación tiene múltiples aristas, por un lado los hallazgos puramente científicos, que señala la importancia de la genética en la enfermedad, identificando varios genes implicados tanto en la severidad de COVID-19 como en la eficiencia del virus en su entrada al huésped, además de mostrar la significancia de factores ambientales tales como el consumo de tabaco. Por otro lado, es fundamental resaltar la importancia de la incorporación de poblaciones poco o nada representadas en los estudios biomédicos mundiales, por ejemplo, en el caso de Magallanes, esta es la primera vez que la población magallánica sale representada en una revista científica de alto impacto. En la publicación de Nature Chile está representado desde Arica a Punta Arenas. Otro aspecto importante es que estos resultados se han podido obtener gracias a un trabajo internacional, de carácter colaborativo y traslacional, basado en la cooperación entre los participantes del estudio, los investigadores básicos y los clínicos, compartiendo no solo datos si no también aproximaciones metodológicas, una tendencia que toma cada vez más peso y que se ha visto reforzada después de la experiencia vivida en la pandemia”
Genética
La segunda actualización del estudio de asociación del genoma completo (GWAS) sobre la gravedad y la susceptibilidad a la infección con SARS-CoV-2, realizado por la Host Genetic Initiative COVID-19, incluyó un meta-análisis que incluyó 219,692 casos y más de 3 millones de controles para evaluar tres fenotipos: enfermedad crítica, hospitalización y susceptibilidad a la infección por SARS-CoV-2, en 82 estudios, de 35 países.
“Se encontraron cinco loci o regiones del genoma que contienen genes involucrados en la vía de entrada del virus al cuerpo humano: SLC6A20 en el cromosoma 3 (p21.31), ABO en el cromosoma 9 (q34.2), SFTPD en el cromosoma 10 (q22.3), ACE2 en el cromosoma X (p22.2) y TMPRSS2 en el cromosoma 21 (q22.3)”, detalló, Fuentes.
En este último gen la variante genética o mutación que muestra la mayor asociación (rs9305744:G>A) contribuiría a que la enfermedad no se manifieste de manera severa, “es decir, sería en parte responsable de que haya casos de COVID-19 más leves y se ha sugerido, además, que podría estar implicado en la menor severidad de la enfermedad en mujeres”, explicó Espinosa.
Igualmente, se replicaron resultados anteriores, encontrando algunas variantes genéticas ya encontradas en estudios anteriores, tales como la variante ubicada en el gen ABO, gen determinante de los grupos sanguíneos A, B, AB o O. Esta variante se encuentra asociada a susceptibilidad a COVID-19 y puede ser atribuida a la presencia de anticuerpos anti-A y anti-B en personas del grupo O, interfiriendo con la proteínas Spike del virus, esto significa que personas del grupo O tendrían un factor protector frente a la severidad de la enfermedad y, por lo tanto, menos probabilidad de enfermar de forma grave.
Conjuntamente, se encontraron cuatro loci que contienen genes candidatos relacionados a los síntomas de defensa del mucus en las vías aéreas, algunos previamente reportados, MUC1/THBS3 en el cromosoma 1 (q22) y MUC5B en el cromosoma 11 (p15.5) así como también nuevas variantes genéticas ubicadas en los genes MUC4 en el cromosoma 3 (q29) y MUC16 en el cromosoma 19 (p13.2).
Se encontró que algunas de las variantes genéticas detectadas aumentan el riesgo de ser infectado por el virus SARS-CoV-2 y otras disminuyen el riesgo de hospitalización por la enfermedad COVID-19, pero no de infección por el virus. Esto muestra diferentes mecanismos que pueden estar relacionando la genética con la gravedad de la enfermedad.
Asimismo, se encontraron seis regiones genómicas que portan genes candidatos causales que están asociados a la vía del Interferón tipo I, importante vía que participa en la regulación del sistema inmune. La variante genética ubicada en el gen IFNA10 localizado en el clúster genético INF-alpha que muestra mayor asociación genera un cambio a nivel de la proteína y aumentaría el riesgo de severidad de la enfermedad.
Además, se usaron complejos análisis estadísticos, como correlaciones genéticas y randomización Mendeliana, para identificar potenciales efectos causales de algunos factores de riesgo sobre COVID-19.
